Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TroQ6DIC6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TroQ6DIC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms