Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3c1Q6DFV6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3c1Q6DFV6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms