Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou4f3Q63955 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou4f3Q63955 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms