Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf260Q62513 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf260Q62513 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms