Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a2Q62203 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms