Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd180Q62192 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms