Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mre11Q61216 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mre11Q61216 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms