Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4Q61107 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4Q61107 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4Q61107 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms