Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3Q60803 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf3Q60803 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms