Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms