Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctf1Q60753 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctf1Q60753 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms