Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynrgQ5SV85 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynrgQ5SV85 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynrgQ5SV85 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms