Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otol1Q4ZJM7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otol1Q4ZJM7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms