Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam228bQ497Q6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms