Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930567H17RikQ3V0K5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms