Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc27Q3V036 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc27Q3V036 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms