Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SfswapQ3USH5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfswapQ3USH5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms