Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms