Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms