Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdlim7Q3TJD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdlim7Q3TJD7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms