Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpusd2Q149F1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpusd2Q149F1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpusd2Q149F1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms