Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zc3h18Q0P678 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms