Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrx2Q06348 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms