Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Caprin2Q05A80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Caprin2Q05A80 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Caprin2Q05A80 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Caprin2Q05A80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Caprin2Q05A80 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Caprin2Q05A80 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms