Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Xrn1P97789 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Xrn1P97789 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Xrn1P97789 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms