Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp2P97473 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tarbp2P97473 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp2P97473 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms