Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frat1P70339 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frat1P70339 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frat1P70339 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms