Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema3eP70275 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema3eP70275 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3eP70275 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms