Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smg6P61406 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg6P61406 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smg6P61406 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smg6P61406 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smg6P61406 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smg6P61406 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smg6P61406 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms