Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nol4P60954 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nol4P60954 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nol4P60954 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms