Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmtd1P59913 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcmtd1P59913 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.2 ms