Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fgd1P52734 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fgd1P52734 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms