Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod1P49813 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod1P49813 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms