Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb41P48193 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb41P48193 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epb41P48193 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.7 ms