Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TfamP40630 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TfamP40630 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TfamP40630 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TfamP40630 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TfamP40630 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TfamP40630 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TfamP40630 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TfamP40630 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TfamP40630 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TfamP40630 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TfamP40630 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TfamP40630 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TfamP40630 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TfamP40630 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TfamP40630 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TfamP40630 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TfamP40630 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TfamP40630 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TfamP40630 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TfamP40630 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TfamP40630 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TfamP40630 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TfamP40630 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TfamP40630 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TfamP40630 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TfamP40630 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TfamP40630 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TfamP40630 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TfamP40630 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TfamP40630 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TfamP40630 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TfamP40630 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TfamP40630 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TfamP40630 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TfamP40630 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TfamP40630 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TfamP40630 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms