Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rom1P32958 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rom1P32958 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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