Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hoxc10P31257 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxc10P31257 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc10P31257 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms