Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Cnga1P29974 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnga1P29974 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cnga1P29974 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cnga1P29974 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cnga1P29974 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cnga1P29974 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cnga1P29974 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnga1P29974 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnga1P29974 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnga1P29974 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnga1P29974 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnga1P29974 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cnga1P29974 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnga1P29974 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnga1P29974 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnga1P29974 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnga1P29974 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cnga1P29974 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cnga1P29974 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cnga1P29974 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cnga1P29974 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cnga1P29974 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cnga1P29974 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnga1P29974 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cnga1P29974 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cnga1P29974 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnga1P29974 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cnga1P29974 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cnga1P29974 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnga1P29974 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms