Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a9P28571 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a9P28571 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 468.1 ms