Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PparaP23204 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PparaP23204 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PparaP23204 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PparaP23204 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PparaP23204 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PparaP23204 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PparaP23204 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PparaP23204 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PparaP23204 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PparaP23204 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PparaP23204 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PparaP23204 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PparaP23204 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PparaP23204 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PparaP23204 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PparaP23204 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PparaP23204 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PparaP23204 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PparaP23204 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PparaP23204 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PparaP23204 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PparaP23204 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PparaP23204 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PparaP23204 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms