Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtpraP18052 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpraP18052 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpraP18052 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms