Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spi1P17433 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms