Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhbP16125 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhbP16125 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhbP16125 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdhbP16125 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdhbP16125 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LdhbP16125 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LdhbP16125 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LdhbP16125 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms