Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf4P11403 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf4P11403 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms