Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb1P09690 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrnb1P09690 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms