Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb3P09026 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb3P09026 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms