Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01647 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P01647 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01647 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01647 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01647 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01647 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01647 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01647 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01647 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01647 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01647 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01647 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01647 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01647 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01647 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01647 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01647 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01647 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01647 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01647 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01647 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01647 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01647 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01647 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01647 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01647 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01647 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
P01647 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01647 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01647 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms