Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp9O88851 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp9O88851 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms