Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BsnO88737 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BsnO88737 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BsnO88737 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BsnO88737 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BsnO88737 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BsnO88737 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BsnO88737 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BsnO88737 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BsnO88737 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BsnO88737 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BsnO88737 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BsnO88737 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BsnO88737 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BsnO88737 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BsnO88737 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BsnO88737 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BsnO88737 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BsnO88737 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BsnO88737 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BsnO88737 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BsnO88737 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BsnO88737 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BsnO88737 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BsnO88737 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BsnO88737 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms