Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Arhgap6O54834 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgap6O54834 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap6O54834 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms